👋Welcome to Bio-OS

Overview

Bio-OS is an open-source platform for genomics users. It provides a workspace which encapsulates data, workflows, Notebooks, job history, etc. Bio-OS provides both GUI and CLI(Command Line Interface) to quickly setup and run workflows specified by languages like WDL and notebook as well.

Bio-OS是一个面向基因组学用户的开源平台。它提供了一个封装数据、工作流、笔记本、工作历史等的工作空间。Bio-OS提供了GUI和CLI（命令行界面）来快速设置和运行由WDL和笔记本等语言指定的工作流。

Bio-OS Concept

1. 开放性：通过社区开源和开放API接口构建跨领域、机构和地区的协作和生态

2. 云原生：基于云原生架构，支持Serverless容器的弹性编排和调度能力

3. 可扩展：通过在架构层面的“接口-实现”解耦合，实现不同程度的可扩展，从而让操作系统针对更多场景具有普适性

4. 标准化：符合国际标准的统一数据接口规范、流程语言规范，生信应用可迁移，生信数据可流转

Bio-OS Workspace

在Bio-OS生信操作系统中，workspace是对一次生信研究过程的完整封装，包括数据，环境，代码，操作计算过程和结果以及作为整体介绍的dashboard，是实现科学研究和临床应用可执行，可移植，可复现，可分享，可发表的基本单位。

Quick links

概览工作空间命令行工具（bioctl）

Get Started

We've put together some helpful guides for you to get setup with our product quickly and easily.

🛠️Getting set up部署Bio-OS