👋Welcome to Bio-OS
Overview
Bio-OS is an open-source platform for genomics users. It provides a workspace which encapsulates data, workflows, Notebooks, job history, etc. Bio-OS provides both GUI and CLI(Command Line Interface) to quickly setup and run workflows specified by languages like WDL and notebook as well.
Bio-OS是一个面向基因组学用户的开源平台。它提供了一个封装数据、工作流、笔记本、工作历史等的工作空间。Bio-OS提供了GUI和CLI(命令行界面)来快速设置和运行由WDL和笔记本等语言指定的工作流。
Bio-OS Concept
开放性:通过社区开源和开放API接口构建跨领域、机构和地区的协作和生态
云原生:基于云原生架构,支持Serverless容器的弹性编排和调度能力
可扩展:通过在架构层面的“接口-实现”解耦合,实现不同程度的可扩展,从而让操作系统针对更多场景具有普适性
标准化:符合国际标准的统一数据接口规范、流程语言规范,生信应用可迁移,生信数据可流转
Bio-OS Workspace
在Bio-OS生信操作系统中,workspace是对一次生信研究过程的完整封装,包括数据,环境,代码,操作计算过程和结果以及作为整体介绍的dashboard,是实现科学研究和临床应用可执行,可移植,可复现,可分享,可发表的基本单位。
Quick links
💡概览工作空间命令行工具(bioctl)Get Started
We've put together some helpful guides for you to get setup with our product quickly and easily.
🛠️Getting set up部署Bio-OSLast updated